Formado en las fuerzas inferiores de los felinos, Cerda escalo importantes peldaños antes de hacer su aparición con el primer equipo en la Copa Libertadores de América 2006 de la mano de Ricardo Ferretti.

Cerda, hijo de un gran jugador en épocas anteriores, demostró ser una de las grandes promesas de la cantera auriazul. A pesar de no tener mucha actividad en sus dos primeros torneos, para el Clausura 2007 se convierte en titular indiscutible del equipo que dirigia Mario Carrillo, participando en los 19 partidos (2 de Liguilla) y anotando 3 goles.

En la epoca de Gallego al mando Cerda tuvo una discreta actuación, siendo sus 2 goles frente a Tecos, en el Apertura 2007, lo más destacado. A la llegada de Manuel Lapuente al timon felino este pierde la continuidad que habia estado teniendo e incluso fue mandado a observar los partidos desde la tribuna en más de una ocasión.

Ya con Daniel Guzmán al mando, formó parte del equipo que conquisto la Superliga 2009, viendo acción unicamente en el segundo partido de la primera fase: la derrota 3-1 ante San Luis, ingresando de cambio.

A sabiendas de que no tendria mucha actividad con el primer equipo Emmanuel Cerda decidio hacer maletas y enrolarse con el Universitario Deportes de Perú para la segunda mitad del 2009, equipo con el cual se coronaria campeón despues de 3 meses, colaborando con 4 actuaciones. A pesar de su buena actuación los dirigentes del club peruano nada pudieron hacer para retenerlo, pues el queria cumplir su sueño de afianzarse como titular en el equipo que lo vio nacer.

Tigres UANL	U. Deportes	Tigres UANL
Clausura 2006 - Clausura 2009	Apertura 2009	Bicentenario 2010 - ?